RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 SDC1P18827 310 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 NTSP30990 170 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 KRT20P35900 424 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 RCAN2Q14206 197 aa25.2■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 RASSF1Q9NS23 344 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 ABCG2Q9UNQ0 655 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC17A7Q9P2U7 560 aa25.17■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 AAGABQ6PD74 315 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 APOOLQ6UXV4 268 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 TSSK3Q96PN8 268 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 TLDC2A0PJX2 215 aa25.15■■□□□ 1.62
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HOXB3-211ENST00000490677 NEFHP12036 1026 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 DGKQP52824 942 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 HSPB3Q12988 150 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 BCL2A1Q16548 175 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 FAM111AQ96PZ2 611 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 SFXN3Q9BWM7 321 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-211ENST00000490677 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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