RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNG2P59768 71 aa15.67■□□□□ 0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTA1P68133 377 aa15.67■□□□□ 0.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2L2Q8NH16 312 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUOMA2VDF0 154 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AHRP35869 848 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNT4P56705 351 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCC1Q96S66 551 aa15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX12O00623 359 aa15.64■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC19A2O60779 497 aa15.64■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F11P03951 625 aa15.64■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
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