RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ANPEPP15144 967 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ADRA1AP35348 466 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CCR2P41597 374 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SULT1E1P49888 294 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBA1BP68363 451 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MYBPC1Q00872 1141 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAF2Q12933 501 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IL24Q13007 206 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RIPK1Q13546 671 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR50Q13585 617 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM7Q14002 265 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM29Q14134 588 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 DMC1Q14565 340 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SBK1Q52WX2 424 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPAT3Q53EU6 434 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PELI3Q8N2H9 469 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RLN3Q8WXF3 142 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MCHR2Q969V1 340 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GANQ9H2C0 597 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MARCH7Q9H992 704 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IL36AQ9UHA7 158 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.95□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NOTCH1P46531 2555 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SNURFLB1AK76 121 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 H3BNX3 289 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 AP3B1O00203 1094 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PPEF2O14830 753 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GPRIN2O60269 458 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NMT2O60551 498 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CYTIPO60759 359 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TOM1L1O75674 476 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 HMBSP08397 361 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RY2P41231 377 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 GEMP55040 296 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1D5P58170 312 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LIN9Q5TKA1 542 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 IL23RQ5VWK5 629 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 LIPJQ5W064 366 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 STOX1Q6ZVD7 989 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF383Q8NA42 475 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM58Q8NG06 486 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T3Q8NH03 318 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PHYHIPQ92561 330 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 P3H4Q92791 437 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCD2Q92925 531 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35C1Q96A29 364 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MOCOSQ96EN8 888 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MARK4Q96L34 752 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 AGPAT1Q99943 283 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 PSD2Q9BQI7 771 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FICDQ9BVA6 458 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 CPVLQ9H3G5 476 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 EBF2Q9HAK2 575 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 HPS4Q9NQG7 708 aa4.94□□□□□ -1.62
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1A2Q9Y585 309 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms