RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HCFC1	P51610	2035 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	EMC8	O43402	210 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TBX19	O60806	448 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WDR1	O75083	606 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	COX6B1	P14854	86 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PTPN6	P29350	595 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PTGDS	P41222	190 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PRR5	P85299	388 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SNTA1	Q13424	505 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PDE7A	Q13946	482 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CASP8	Q14790	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CBR3	O75828	277 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf47	O95873	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HPN	P05981	417 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ALOX5	P09917	674 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA1	P14867	456 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	AGA	P20933	346 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNB4	P30926	498 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	EVI2B	P34910	448 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	EMX2	Q04743	252 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SRY	Q05066	204 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SORT1	Q99523	831 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DPY30	Q9C005	99 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	IL33	O95760	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GLI4	P10075	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PRIM2	P49643	509 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NME5	P56597	212 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MARCH3	Q86UD3	253 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	IFNE	Q86WN2	208 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TIMP4	Q99727	224 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP26	Q9BV47	211 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DSN1	Q9H410	356 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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