RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF716A6NP11 495 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPA12AO43301 675 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 RAD51CO43502 376 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 AVILO75366 819 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZWINTO95229 277 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DDAH2O95865 285 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LDLRP01130 860 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 INHBAP08476 426 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FBP1P09467 338 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF735P0CB33 412 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CBSLP0DN79 551 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A4P14672 509 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF28P17035 718 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NMBRP28336 390 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CBSP35520 551 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DLSTP36957 453 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CRATP43155 626 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR4P46093 362 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PKNOX1P55347 436 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TPTEP56180 551 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NCALDP61601 193 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNJ2P63252 427 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DEFA6Q01524 100 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MC2RQ01718 297 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PUDPQ08623 228 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MGAT5Q09328 741 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ABHD18Q0P651 414 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MERTKQ12866 999 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PRKAA1Q13131 559 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP1A4Q13733 1029 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CBFBQ13951 182 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DS5Q14953 304 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CDK10Q15131 360 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 POU4F3Q15319 338 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL26Q53HC5 615 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PCID2Q5JVF3 399 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ATG16L1Q676U5 607 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 DET1Q7L5Y6 550 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 BIVMQ86UB2 503 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD46Q86W74 232 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MREGQ8N565 214 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2L2Q8NH16 312 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MITD1Q8WV92 249 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 S100PBPQ96BU1 408 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TXNDC15Q96J42 360 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF597Q96LX8 424 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 C5orf34Q96MH7 638 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 INTS14Q96SY0 518 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT12Q99456 494 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ZBTB18Q99592 522 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MIPEPQ99797 713 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM160Q9NX00 188 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 BFARQ9NZS9 450 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 COPS3Q9UNS2 423 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 SPTBP11277 2137 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PPE2 198 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PR64 198 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 PIPSLA2A3N6 862 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 MGAT4DA6NG13 374 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRTM2O43300 516 aa6.84□□□□□ -1.31
RPUSD3-212ENST00000466141 ASNA1O43681 348 aa6.84□□□□□ -1.31
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