RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 TFF2Q03403 129 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 RUNX1T1Q06455 604 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ENPP2Q13822 863 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TRAM2Q15035 370 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 BAK1Q16611 211 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NDUFA9Q16795 377 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF425Q6IV72 752 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NRROSQ86YC3 692 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM163Q8TC26 289 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM255BQ8WV15 326 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 DIO2Q92813 273 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GIMAP5Q96F15 307 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 OR2M4Q96R27 311 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 MCHR1Q99705 422 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PBX4Q9BYU1 374 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 MARCH7Q9H992 704 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ABCB9Q9NP78 766 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SNX7Q9UNH6 387 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A075B6Q4 140 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GSAPA4D1B5 854 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 EPOPA6NHQ4 379 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM183AA6NL82 134 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 AP3D1O14617 1153 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CTSVO60911 334 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SNX4O95219 450 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LALBAP00709 142 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 APOA1P02647 267 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 MSL3P1P0C860 447 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NPIPA8P0DM63 369 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ACADMP11310 421 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GSTM3P21266 225 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CPN2P22792 545 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SSTR4P31391 388 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ETV6P41212 452 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NR4A2P43354 598 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT4P56705 351 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 EFNB1P98172 346 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 INSL4Q14641 139 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GPR68Q15743 365 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 KCNJ8Q15842 424 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PAQR7Q86WK9 346 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PIGXQ8TBF5 258 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PIK3R3Q92569 461 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 FGF11Q92914 225 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ARHGDIGQ99819 225 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CAPN10Q9HC96 672 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 V9GYH0 126 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PRODHO43272 600 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ASNA1O43681 348 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 RASGRP1O95267 797 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 GKN3PP0CG01 181 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LIMS3P0CW19 117 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 LIMS4P0CW20 117 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 ACP2P11117 423 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PRG2P13727 222 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 HOXB2P14652 356 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 PVRP15151 417 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 CPEP16870 476 aa7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-204ENST00000451422 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms