RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TMEM198Q66K66 360 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NOXRED1Q6NXP6 359 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.67□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.66□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 SMPDL3BQ92485 455 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 KAT2AQ92830 837 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NTNG2Q96CW9 530 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DTNBP1Q96EV8 351 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 RILPQ96NA2 401 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DACH2Q96NX9 599 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TSSK3Q96PN8 268 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SIKE1Q9BRV8 207 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SH2D2AQ9NP31 389 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.66□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EML6Q6ZMW3 1958 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CD8B2A6NJW9 211 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.65□□□□□ -0.7
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PRAME-210ENST00000442481 AKAP10O43572 662 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PEX11AO75192 247 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC6AO75865 159 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 SNX4O95219 450 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ATP1B1P05026 303 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 FBXO45P0C2W1 286 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 CTSSP25774 331 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 GSTM5P46439 218 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 MASP1P48740 699 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.72e-8■□□□□ 8.3
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PRAME-210ENST00000442481 FUT7Q11130 342 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 DUSP8Q13202 625 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 NXNQ6DKJ4 435 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 EPGNQ6UW88 154 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 PACS2Q86VP3 889 aa10.65□□□□□ -0.7
PRAME-210ENST00000442481 P3H2Q8IVL5 708 aa10.65□□□□□ -0.7
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