RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PRPH2P23942 346 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 NTSP30990 170 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MC3RP41968 323 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS53Q2L4Q9 553 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K17Q8NGC6 315 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01560Q8TB33 94 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GLIPR2Q9H4G4 154 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PPCSQ9HAB8 311 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT8Q9NY28 637 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PACSIN3Q9UKS6 424 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MED12Q93074 2177 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPM1 405 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01387J3KSC0 135 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 UPK1AO00322 258 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 FADS1O60427 444 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF13O75888 250 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RAF1P04049 648 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 STARP49675 285 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DIO3P55073 304 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM107Q6UX40 140 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TDRPQ86YL5 185 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR2M3Q8NG83 312 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 AMDHD1Q96NU7 426 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 Q9N2J8 555 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SDHAF3Q9NRP4 125 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MTORP42345 2549 aa18.99■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TTC36A6NLP5 189 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 A8MXE2 369 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PLIN3O60664 434 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 UROSP10746 265 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PEPDP12955 493 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CRHR1P34998 444 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CPA2P48052 419 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CCT5P48643 541 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0040Q15053 153 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DECR1Q16698 335 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 FBXW10Q5XX13 1052 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR2A2Q6IF42 318 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 LUZP2Q86TE4 346 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT2Q8N0V5 402 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SMPDL3BQ92485 455 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ELP4Q96EB1 424 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OXSMQ9NWU1 459 aa18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MED12LQ86YW9 2145 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PNV4 684 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MSTNO14793 375 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SCO2O43819 266 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CRCPO75575 148 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ATE1O95260 518 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 IL33O95760 270 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R2AP63151 447 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OCRLQ01968 901 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP157Q5JU67 520 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PTGES2Q9H7Z7 377 aa18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SH3D21A4FU49 640 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TGM6O95932 706 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 HRGP04196 525 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 KLK2P20151 261 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 HOMEZQ8IX15 550 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MEIOBQ8N635 442 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL1Q96LA6 429 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DSN1Q9H410 356 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf14Q9HBI5 128 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.96■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A20A6NK97 555 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf51A8MQB3 221 aa18.95■□□□□ 0.62
LIMS1-208ENST00000428064 TBX19O60806 448 aa18.95■□□□□ 0.62
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