RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 RECKO95980 971 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 IFI6P09912 130 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC159P0C7I6 412 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ANXA8P13928 327 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CRHBPP24387 322 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GSTT1P30711 240 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MPIP34949 423 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 LIMS1P48059 325 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 HMGA2P52926 109 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NUP107P57740 925 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZBED5Q49AG3 693 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 KRT73Q86Y46 540 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 LGI4Q8N135 537 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 APOL4Q9BPW4 351 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 BTBD2Q9BX70 525 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 UCK1Q9HA47 277 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NTMQ9P121 344 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 POMT2Q9UKY4 750 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0J9YVX5 310 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SERPINB7O75635 380 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 PRF1P14222 555 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ETS2P15036 469 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 IL7RP16871 459 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ALOX12P18054 663 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MATN1P21941 496 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ELK4P28324 431 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CD1CP29017 333 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 KCNJ5P48544 419 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CRISP3P54108 245 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 HHEXQ03014 270 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 DUSP2Q05923 314 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 LAPTM4AQ15012 233 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GPR141Q7Z602 305 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GPR32P1Q8NGA4 272 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 PROX1Q92786 737 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ENOPH1Q9UHY7 261 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GLOD5A6NK44 160 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 B4DGG1 531 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 H0YGG7 62 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SLC1A7O00341 560 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 OR12D1P0DN82 309 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TNFRSF1BP20333 461 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CPN2P22792 545 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CDH12P55289 794 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CXCR4P61073 352 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 RAPSNQ13702 412 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MICAQ29983 383 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SMYD1Q8NB12 490 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 RAB8BQ92930 207 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 DAPP1Q9UN19 280 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SPACA6W5XKT8 324 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 LILRA5A6NI73 299 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 SLITRK5O94991 958 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRC-206ENST00000413409 NR2F1P10589 423 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms