RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391218.1

RNU6-1250P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1250, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1250P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SEPT10Q9P0V9 454 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SIRPGQ9P1W8 387 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 POLKQ9UBT6 870 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CTSFQ9UBX1 484 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DDX19BQ9UMR2 479 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NFU1Q9UMS0 254 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SMC3Q9UQE7 1217 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBX22Q9Y458 520 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NPHP3Q7Z494 1330 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MYO7AQ13402 2215 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 A0A0A6YYD4 124 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR2A25A4D2G3 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR5H15A6NDH6 313 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF716A6NP11 495 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KNCNA6PVL3 124 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CLCA1A8K7I4 914 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 A8MVM7 634 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NPIPA2E9PIF3 369 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NPIPA3F8WFD2 350 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MANBAO00462 879 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MAP2K7O14733 419 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GABRDO14764 452 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PIP5K1BO14986 540 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ARPC2O15144 300 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 B4GAT1O43505 415 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ASNA1O43681 348 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SYNGR2O43760 224 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GUCY1B2O75343 617 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TSPAN9O75954 239 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ERLIN2O94905 339 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CLSTN1O94985 981 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NKX2-2O95096 273 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AKR7A3O95154 331 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CDS2O95674 445 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL33O95760 270 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LHBP01229 141 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGLV2-23P01705 113 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CD2P06729 351 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 WNT2P09544 360 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR56A5P0C7T3 313 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF735P0CB33 412 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SMIM18P0DKX4 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ESDP10768 282 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PVRP15151 417 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FOSL2P15408 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IMPDH1P20839 514 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBXA2RP21731 343 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 VDAC1P21796 283 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SPRR2EP22531 72 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 BDNFP23560 247 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COX7A1P24310 79 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NMBRP28336 390 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SERPINA4P29622 427 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DUTP33316 252 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GP5P40197 560 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PNPLA4P41247 253 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 BTDP43251 543 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RAD52P43351 418 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LGALS7P47929 136 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ALDH3B2P48448 385 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LIM2P55344 173 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CLDN15P56746 228 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RWDD2BP57060 319 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RAP1AP62834 184 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KCNJ2P63252 427 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TSPY1Q01534 308 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC34A1Q06495 639 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LCP2Q13094 533 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SERINC3Q13530 473 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FGFBP1Q14512 234 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF266Q14584 549 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KCTD2Q14681 263 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CASP8Q14790 479 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NAA25Q14CX7 972 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CDK5R1Q15078 307 aa-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms