RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGUQ9H490 435 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
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PGGT1B-202ENST00000379615 FLNCQ14315 2725 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF3C1Q12789 2109 aa14.11□□□□□ -0.15
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC10A1Q14973 349 aa14.1□□□□□ -0.15
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PGGT1B-202ENST00000379615 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.1□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.1□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.1□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 C9JVG2 144 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ICOSLGO75144 302 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ANP32DO95626 131 aa14.09□□□□□ -0.15
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4B1P13584 511 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1C1P21283 382 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 MATN1P21941 496 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ARFIP2P53365 341 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 BICRALQ6AI39 1079 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO30Q8TB52 745 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3R3Q92569 461 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 EXD2Q9NVH0 621 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1B-202ENST00000379615 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK2O95069 426 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 UTS2O95399 124 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT75O95678 551 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 HPGDP15428 266 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEA8P43361 318 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 UQCRFS1P47985 274 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPC1P48995 793 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.16
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PGGT1B-202ENST00000379615 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.08□□□□□ -0.16
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM110BQ8TC76 370 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CDS1Q92903 461 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NEURL3Q96EH8 262 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OR7D2Q96RA2 312 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.08□□□□□ -0.16
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PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SNPHO15079 494 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 HCN1O60741 890 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CBR3O75828 277 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NGFRP08138 427 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GDF1P27539 372 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 EVI2BP34910 448 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GCKP35557 465 aa14.07□□□□□ -0.16
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