RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF318Q5VUA4 2279 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 USP6P35125 1406 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BTX0 84 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF11O14788 317 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ALOX15BO15296 676 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC22BO75396 215 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPAN8P19075 237 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV1-2P23083 117 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB25P24278 435 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LYZP61626 148 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKCEQ02156 737 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 Q7L0L9 218 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR65Q8IYL9 337 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL10Q8N8L6 244 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 OR13F1Q8NGS4 319 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ADIPOR1Q96A54 375 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMD8Q96LT4 415 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 DPH7Q9BTV6 452 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF222A6NCQ9 220 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS8O00214 317 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LATO43561 262 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RAMP1O60894 148 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TGFAP01135 160 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF19P17023 458 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 HTR5AP47898 357 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2V2Q15819 145 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ISXQ2M1V0 245 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF677Q86XU0 584 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf40Q8IXQ3 194 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MCOLN2Q8IZK6 566 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGR1BQ92637 280 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TADA1Q96BN2 335 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL4Q99706 377 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX13BQ9BXU2 312 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPV5Q9NQA5 729 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IL17CQ9P0M4 197 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL21Q9UJP4 597 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CELA1Q9UNI1 258 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 BICDL2A1A5D9 508 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 JCHAINP01591 159 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.973e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RABIFP47224 123 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RGRP47804 291 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TFDP1Q14186 410 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP51A1Q16850 503 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LDLRAP1Q5SW96 308 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 STAC2Q6ZMT1 411 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 VASH2Q86V25 355 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MCHR2Q969V1 340 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C14orf79Q96F83 325 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GALT6Q96L58 329 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB17Q9H0T7 212 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EHFQ9NZC4 300 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CA5BQ9Y2D0 317 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CUX2O14529 1486 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCC4O15439 1325 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EPOPA6NHQ4 379 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PDXKO00764 312 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CASKO14936 926 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD3O95274 346 aa2.74□□□□□ -1.97
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