RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CPNE6O95741 557 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 STOMP27105 288 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CD83Q01151 205 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BEND4Q6ZU67 534 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAP3K3Q99759 626 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BEX2Q9BXY8 128 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ACPTQ9BZG2 426 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BEX1Q9HBH7 125 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYNNQ9NPC7 610 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 STARD5Q9NSY2 213 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MARCH5Q9NX47 278 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 VAPAQ9P0L0 249 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NUP98P52948 1817 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RFXAPO00287 272 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LDB3O75112 727 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KLKB1P03952 638 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CSF2P04141 144 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UBL4AP11441 157 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 INHBCP55103 352 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TDHQ8IZJ6 230 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RFT1Q96AA3 541 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 VDAC3Q9Y277 283 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GGT3PA6NGU5 568 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 YES1P07947 543 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GTF2F2P13984 249 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GNRHRP30968 328 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EFR3AQ14156 821 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C22orf42Q6IC83 251 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TRNP1Q6NT89 227 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRR22Q8IZ63 422 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR8H3Q8N146 312 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ADOQ96SZ5 270 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FN3KQ9H479 309 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYH3P11055 1940 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1B0GVC2 190 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR7A10O76100 309 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FUT1P19526 365 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SHFQ7M4L6 423 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SSX6Q7RTT6 188 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EDAQ92838 391 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SMOXQ9NWM0 555 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJC13O75165 2243 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CENPBD1B2RD01 187 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LRRTM2O43300 516 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 EDIL3O43854 480 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GPR75O95800 540 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IFNA7P01567 189 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DCTP40126 519 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 APOFQ13790 326 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CPZQ66K79 652 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SAMD8Q96LT4 415 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CCL26Q9Y258 94 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GABRR3A8MPY1 467 aa9.73□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PPP6CO00743 305 aa9.73□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BMP2P12643 396 aa9.73□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PCGF2P35227 344 aa9.73□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 AHRP35869 848 aa9.73□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MLC1Q15049 377 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms