RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 CDH24Q86UP0 819 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 OR2T29Q8NH02 315 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K3Q99759 626 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 OR51I1Q9H343 314 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 NT5DC2Q9H857 520 aa16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ITGA2P17301 1181 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFS1P28331 727 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SHEQ5VZ18 495 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EID3Q8N140 333 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR10Z1Q8NGY1 313 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC7A6Q92536 515 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TLR4O00206 839 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FRS3O43559 492 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 AHRP35869 848 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZP2Q05996 745 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EPS8Q12929 822 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SYT16Q17RD7 645 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ARL14Q8N4G2 192 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 M0R129 80 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 RECKO95980 971 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FOSL1P15407 271 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ACVR2AP27037 513 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PCGF2P35227 344 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TALDO1P37837 337 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CDH12P55289 794 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR8H2Q8N162 312 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 APOL4Q9BPW4 351 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MKLN1Q9UL63 735 aa16.76■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SEMA7AO75326 666 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ETV1P50549 477 aa16.75■□□□□ 0.27
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PDE4D-204ENST00000358923 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 FAPQ12884 760 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 KIR2DS3Q14952 304 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TTLQ8NG68 377 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MTERF3Q96E29 417 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GIMAP5Q96F15 307 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 RDH12Q96NR8 316 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 QRFPRQ96P65 431 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 DOHHQ9BU89 302 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PLD2O14939 933 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SLC28A2O43868 658 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SNX4O95219 450 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GNA13Q14344 377 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 AMZ1Q400G9 498 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SAXO2Q658L1 398 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 USP53Q70EK8 1073 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PR77 199 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 I3L521 148 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ANGPTL1O95841 491 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 HPRP00739 348 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SEMG1P04279 462 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CPN2P22792 545 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 CD27P26842 260 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 MAGEA2P43356 314 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ISL1P61371 349 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 SHC2P98077 582 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 HOXC5Q00444 222 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 IL5RAQ01344 420 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 VEZF1Q14119 521 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4D-204ENST00000358923 ERICH5Q6P6B1 374 aa16.74■□□□□ 0.27
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