RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354558.7

CKAP5-202, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP5, Length 6,428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-202ENST00000354558 RTP5Q14D33 572 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 LIPNQ5VXI9 398 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR4F3Q6IEY1 312 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 BANPQ8N9N5 519 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CCDC107Q8WV48 283 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 FGF21Q9NSA1 209 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 NID2Q14112 1375 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SMPD2O60906 423 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 AK1P00568 194 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 IFNA17P01571 189 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 MPC1LP0DKB6 136 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ETV5P41161 510 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RGS19P49795 217 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ASRGL1Q7L266 308 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR5AS1Q8N127 324 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SMOQ99835 787 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TMED9Q9BVK6 235 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 E9PI62 339 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 BCKDKO14874 412 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PIP5K1CO60331 668 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CRYAAP02489 173 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PRF1P14222 555 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 BMP5P22003 454 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TUBG1P23258 451 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PTGS2P35354 604 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RFC3P40938 356 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 HMGCS1Q01581 520 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PIGFQ07326 219 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR8G1Q15617 311 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 LILRB2Q8N423 598 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZFP3Q96NJ6 502 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CCL19Q99731 98 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZNF350Q9GZX5 532 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZBP1Q9H171 429 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TRBC2A0A5B9 178 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR2AT4A6NND4 320 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 H7C417 338 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 CXCR6O00574 342 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SYT7O43581 403 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 IL3P08700 152 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TFPTP0C1Z6 253 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 FAM163BP0C2L3 166 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 EPXP11678 715 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ZNF12P17014 697 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ATF6P18850 670 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RGS6P49758 472 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SGSHP51688 502 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 MXD1Q05195 221 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 SULF2Q8IWU5 870 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ST8SIA4Q92187 359 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 NR4A3Q92570 626 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 TAAR8Q969N4 342 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-202ENST00000354558 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms