RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CRISP3P54108 245 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CDK6Q00534 326 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 FUT5Q11128 374 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 SYPL1Q16563 259 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CCNJQ5T5M9 372 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PTOV1Q86YD1 416 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ZZZ3Q8IYH5 903 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 BEST3Q8N1M1 668 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 POLE3Q9NRF9 147 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa25.61■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 STX11O75558 287 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 SOX3P41225 446 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 GSK3BP49841 420 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PNLIPRP2P54317 469 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 TBR1Q16650 682 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 VMACQ2NL98 169 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 SLC30A8Q8IWU4 369 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 TNIP2Q8NFZ5 429 aa25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CASRP41180 1078 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 MFAP5Q13361 173 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 SCARB2Q14108 478 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 LYPD8Q6UX82 237 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00696Q6ZRV3 163 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ANKFN1Q8N957 763 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM19Q96HH6 336 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 COL21A1Q96P44 957 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 THTPAQ9BU02 230 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF350Q9GZX5 532 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ANGPT4Q9Y264 503 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ELOVL7A1L3X0 281 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PRORSD1PA6NEY8 169 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 OR6C70A6NIJ9 312 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 TSPAN2O60636 221 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 H6PDO95479 791 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 GUSBP08236 651 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 HSD17B1P14061 328 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 LCN1P31025 176 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 REEP3Q6NUK4 255 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 MICU2Q8IYU8 434 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 RNF148Q8N7C7 305 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 NFKBIDQ8NI38 313 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 MCUR1Q96AQ8 359 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ADOQ96SZ5 270 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 HPF1Q9NWY4 346 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 CD300AQ9UGN4 299 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 WDR45Q9Y484 360 aa25.59■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 HS6ST1O60243 411 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 OR6B1O95007 311 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV1D-16P01601 117 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 PCGF2P35227 344 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 EFR3AQ14156 821 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 NTRK2Q16620 822 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 GALNT10Q86SR1 603 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 HIPK4Q8NE63 616 aa25.58■■□□□ 1.69
GIPC1-201ENST00000345425 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 CHRM4P08173 479 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 CYB561P49447 251 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 HLCSP50747 726 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK11Q15759 364 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 IL20RBQ6UXL0 311 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 NUP54Q7Z3B4 507 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 RNF32Q9H0A6 362 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO34Q9NWN3 711 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 PACSIN3Q9UKS6 424 aa25.57■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 GSC2O15499 205 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 CEACAM7Q14002 265 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 VEZF1Q14119 521 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 BBS10Q8TAM1 723 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 PMM1Q92871 262 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 EXTL1Q92935 676 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 USP22Q9UPT9 525 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 ACACBO00763 2458 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 EXPH5Q8NEV8 1989 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JPF8 293 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 TP53I11O14683 189 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa25.56■■□□□ 1.68
GIPC1-201ENST00000345425 HTR1EP28566 365 aa25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms