RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 KRT8P05787 483 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 TNFRSF17Q02223 184 aa14.85□□□□□ -0.03
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.85□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 SOX30O94993 753 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFB-201ENST00000331163 CH25HO95992 272 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 RNF44Q7L0R7 432 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 ITPKCQ96DU7 683 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 ADOQ96SZ5 270 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFB-201ENST00000331163 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDGFB-201ENST00000331163 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.84□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 A0A1B0GTQ1 180 aa14.83□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.83□□□□□ -0.03
PDGFB-201ENST00000331163 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.83□□□□□ -0.03
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PDGFB-201ENST00000331163 DEFB124Q8NES8 71 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 NAT6Q93015 286 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFB-201ENST00000331163 GADD45GO95257 159 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFB-201ENST00000331163 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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PDGFB-201ENST00000331163 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFB-201ENST00000331163 ANGPTL1O95841 491 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ALPPP05187 535 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ELP4Q96EB1 424 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFB-201ENST00000331163 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.82□□□□□ -0.04
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