RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 HK1P19367 917 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 KRT74Q7RTS7 529 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR8H3Q8N146 312 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 GHDCQ8N2G8 530 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR51G2Q8NGK0 314 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 COQ10AQ96MF6 247 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ABHD1Q96SE0 405 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SLC23A2Q9UGH3 650 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CBLCQ9ULV8 474 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 USP34Q70CQ2 3546 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CIB4A0PJX0 185 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 PAPLNO95428 1278 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 THY1P04216 161 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 GPR1P46091 355 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TMEM107Q6UX40 140 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF793Q6ZN11 406 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SAMD12Q8N8I0 201 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 GPR137Q96N19 417 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TIMP4Q99727 224 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CDCP1Q9H5V8 836 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 B3GNT2Q9NY97 397 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 PGRMC2O15173 223 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NDUFS4O43181 175 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR1F1O43749 312 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SLC22A5O76082 557 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ATP12AP54707 1039 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NUDT13Q86X67 352 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 EQTNQ9NQ60 294 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CLEC4AQ9UMR7 237 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.68■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CCL16O15467 120 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF250P15622 560 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CPOQ8IVL8 374 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RFT1Q96AA3 541 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NACC2Q96BF6 587 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 KLHL31Q9H511 634 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 LRRK1Q38SD2 2015 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RNF13O43567 381 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SLC19A2O60779 497 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 LRG1P02750 347 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 FUT1P19526 365 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 THBS2P35442 1172 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TEX261Q6UWH6 196 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 LINC00471Q8N535 108 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF680Q8NEM1 530 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 BBS10Q8TAM1 723 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 DIO2Q92813 273 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ARMC5Q96C12 935 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R16AQ96I34 528 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF558Q96NG5 402 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 AIF1LQ9BQI0 150 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 POLHQ9Y253 713 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 U3KQ87 197 aa23.67■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 C4orf51C9J302 202 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 IGHA1P01876 353 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 AHRP35869 848 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NUDT1P36639 197 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 POU4F3Q15319 338 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ZNF311Q5JNZ3 666 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR4N4Q8N0Y3 316 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RAD51AP1Q96B01 352 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CHFRQ96EP1 664 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 BTBD1Q9H0C5 482 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 GHITMQ9H3K2 345 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 GLTPQ9NZD2 209 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RASD1Q9Y272 281 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 COL4A6Q14031 1691 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 E9PI62 339 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 BTN3A3O00478 584 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SHOXO15266 292 aa23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 NRMQ8IXM6 262 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms