RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295628.3

LRRC58-201, Transcript of leucine rich repeat containing 58, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC58, Length 7,903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58-201ENST00000295628 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 NDNFQ8TB73 568 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 VEGFDO43915 354 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TEAD2Q15562 447 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SULF2Q8IWU5 870 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OR5W2Q8NH69 310 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 UHRF2Q96PU4 802 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CHD4Q14839 1912 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PRSS3P35030 304 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TDGQ13569 410 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ZNF783Q6ZMS7 281 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 LRP5LA4QPB2 252 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 MTNR1AP48039 350 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC14A1Q13336 389 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 BTN1A1Q13410 526 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SFXN5Q8TD22 340 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PEX11GQ96HA9 241 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 FETUBQ9UGM5 382 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 H0YAE9 185 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 RAB3DO95716 219 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CBX7O95931 251 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ITGB2P05107 769 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 UBE2G2P60604 165 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PCLAFQ15004 111 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ELOCQ15369 112 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 KBTBD6Q86V97 674 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 DIP2AQ14689 1571 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 H3BML4 177 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 RAB27BO00194 218 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 GPR50Q13585 617 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 VHLLQ6RSH7 139 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 E9PCH4 1651 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ADGRB3O60242 1522 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CNTN5O94779 1100 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 FBXO45P0C2W1 286 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ARSBP15848 533 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TGM1P22735 817 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TAS2R31P59538 309 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 GRB7Q14451 532 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 S100A7AQ86SG5 101 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SCLYQ96I15 445 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CACNG2Q9Y698 323 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TNS2Q63HR2 1409 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 C2orf78A6NCI8 922 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 AKAIN1P0CW23 69 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SERPINA2P20848 420 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 S100A7P31151 101 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 COPS3Q9UNS2 423 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 EFCAB7A8K855 629 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 EMC8O43402 210 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 FBXO24O75426 580 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 ZNF30P17039 623 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 RAB3AP20336 220 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SHMT2P34897 504 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SCAPQ12770 1279 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OPA3Q9H6K4 179 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 NSDHLQ15738 373 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 FBXL16Q8N461 479 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRC58-201ENST00000295628 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms