RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251102.12

CNGB1-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel beta 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGB1, Length 5,641 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1-201ENST00000251102 MUSKO15146 869 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CACNG3O60359 315 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 RAD51DO75771 328 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HLA-EP13747 358 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 AP1S3Q96PC3 154 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 COPS3Q9UNS2 423 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 K7ERQ8 282 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HOXC12P31275 282 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ESCO2Q56NI9 601 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 GLTPQ9NZD2 209 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 UGDHO60701 494 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF254O75437 659 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC26A5P58743 744 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 HMGB4Q8WW32 186 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SCLYQ96I15 445 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TDP1Q9NUW8 608 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 Q9Y3F1 56 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 NUDT7P0C024 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 DOK4Q8TEW6 326 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CDC6Q99741 560 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TXNL1O43396 289 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TNFP01375 233 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 DLX5P56178 289 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 PTPRRQ15256 657 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 TMEM163Q8TC26 289 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 STK35Q8TDR2 534 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGB1-201ENST00000251102 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 HCRTR2O43614 444 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 PTHP01270 115 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 UBBP0CG47 229 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 NOVP48745 357 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 GHRHRQ02643 423 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 NTMT1Q9BV86 223 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 NTN4Q9HB63 628 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 FABP7O15540 132 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 GABRPO00591 440 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 E2F3O00716 465 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 GPR32O75388 356 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 AK1P00568 194 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 CDK2P24941 298 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF91Q05481 1191 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 DEFB134Q4QY38 66 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 LACC1Q8IV20 430 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 GABRR3A8MPY1 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 DNAJB6O75190 326 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 TGM6O95932 706 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 MMP12P39900 470 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 FAPQ12884 760 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 MBTPS1Q14703 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGB1-201ENST00000251102 C2orf27AQ580R0 203 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms