RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
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ITGA3-201ENST00000007722 HSD3B2P26439 372 aa12.32□□□□□ -0.44
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ITGA3-201ENST00000007722 ERVK-25P63136 954 aa12.32□□□□□ -0.44
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ITGA3-201ENST00000007722 OAFQ86UD1 273 aa12.32□□□□□ -0.44
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.32□□□□□ -0.44
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