RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PpcdcQ8BZB2 204 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam46bQ8C152 427 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssuh2Q8C3L1 340 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lancl3Q8CD19 420 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sphk1Q8CI15 382 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ahsa2Q8N9S3 331 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FbrsQ8R089 466 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35b3Q922Q5 369 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r16aQ923M0 524 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf524Q9D0B1 321 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex13Q9D0K1 405 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam166aQ9D4K5 319 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgat4dQ9D4R2 373 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Izumo2Q9DA16 220 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ift22Q9DAI2 185 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med27Q9DB40 311 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Insm2Q9JMC2 493 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srebf1Q9WTN3 1134 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-BlV9GXR0 257 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup214Q80U93 2085 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trbc2A0A075B5J4 173 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7145A0A087WS64 360 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11127A7VMS2 374 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11397F6V5V4 377 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh5O55240 318 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TertO70372 1122 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pmp22P16646 161 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wnt6P22727 364 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LipcP27656 510 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk5P49615 292 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sult2a1P52843 285 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drd2P61168 444 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EvlP70429 414 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtf1Q07243 675 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HgfQ08048 728 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fezf1Q0VDQ9 475 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FuzQ3UYI6 415 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xkr9Q5GH62 373 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pabpc2Q62029 628 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp866Q6PGD2 520 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd3eapQ76KJ5 399 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r110Q7M712 333 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmc6Q7TN60 810 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr176Q80WT4 515 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd99l2Q8BIF0 237 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adipor2Q8BQS5 386 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam69cQ8BQT2 410 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r87Q8R255 295 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1391Q8VFA4 311 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Frs3Q91WJ0 492 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taldo1Q93092 337 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl22Q99JN2 634 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med18Q9CZ82 208 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933421I07RikQ9D420 214 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TsaccQ9DA44 124 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HaghlQ9DB32 283 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpysl5Q9EQF6 564 aa6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arpc3Q9JM76 178 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dmrtb1A2A9I7 359 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LexmA2AVQ5 414 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sac3d1A6H687 427 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7275E9Q1B3 247 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr605E9Q838 314 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2d37-psF6YKB5 150 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10799F7C7U2 104 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r13L7N1X2 831 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nmur1O55040 428 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtnd2P03893 345 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 En2P09066 324 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Id2P41136 134 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxd13P70217 339 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cct3P80318 545 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SmsP97355 366 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NrtnP97463 195 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam187bQ0VAY3 358 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec24aQ3U2P1 1090 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr162Q3UN16 588 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr2f1Q60632 422 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ToxQ66JW3 526 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Morn4Q6PGF2 146 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1161Q7TR29 321 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr765Q7TRI6 309 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb9fQ80UK5 377 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb42Q811H0 420 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc26a9Q8BU91 790 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Catsper4Q8BVN3 442 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yipf4Q8C407 246 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc119bQ8C4B4 251 aa6.22□□□□□ -1.41
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acat2Q8CAY6 397 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.9 ms