RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TstP52196 297 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MazP56671 477 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KapP61110 121 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crybb2P62696 205 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akt2Q60823 481 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Muc19Q6JHY2 733 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubfd1Q78JW9 368 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zik1Q80YP6 463 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Commd7Q8BG94 200 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nipal3Q8BGN5 410 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd14Q8K070 417 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcfd2Q8K5B2 145 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grhl2Q8K5C0 625 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdhr1Q8VHP6 859 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex16Q91XC9 336 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcoxlQ9DBS4 632 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aif1lQ9EQX4 150 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxa1B1AUS7 101 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp599E9PWP1 548 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5796E9Q7M8 205 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss56F2YMG0 604 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr631F8VPJ9 319 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3629K7N6Y2 205 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10340K7N708 205 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-Q1O19441 368 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rem1O35929 297 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NelfeP19426 375 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad52P43352 420 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcl3Q6W5C0 100 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hat1Q8BY71 416 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl22Q8C7B6 236 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr450Q8VF81 310 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk2gQ923T9 529 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp2Q9D2H6 612 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift46Q9DB07 301 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GhrlQ9EQX0 117 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sars2Q9JJL8 518 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cytl1A1E5L0 139 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox2fA2ANE0 191 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6fP35460 134 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc42P60766 191 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp1P98063 991 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrtamQ149L7 389 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem248Q3TBN1 314 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Garem1Q3UFT3 876 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcho2Q3UQN2 809 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm732Q3V0P9 516 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep44Q5HZK1 386 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cramp1Q6PG95 1285 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnptgQ6S5C2 307 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vangl1Q80Z96 526 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tctn1Q8BZ64 593 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp11Q8CB67 483 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sertm1Q8CD78 107 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin4Q8K1L2 249 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nphs2Q91X05 385 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NaaaQ9D7V9 362 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emc7Q9EP72 241 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpini2Q9JK88 405 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hey1Q9WV93 299 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr49Q9Z1V0 313 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox13F6YCR7 232 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfl2P45591 166 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efna1P52793 205 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab42Q0PD08 215 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc27a5Q4LDG0 689 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk6Q64261 326 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bbs4Q8C1Z7 520 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec14aQ8VCP9 459 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cts7Q91ZF2 331 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grip1Q925T6 1127 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glipr1Q9CWG1 255 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx20Q9D2Y5 313 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpn3Q9D3W4 284 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DstnQ9R0P5 165 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Greb1Q3UHK3 1954 aa11.9□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv6-20A0A140T8P2 115 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm436B1AVU6 407 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5475D3YV11 175 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr549E9Q542 316 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17555F6U8B9 371 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JtbO88824 146 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gh1P06880 216 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il1r2P27931 410 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk6Q3TBV4 313 aa11.89□□□□□ -0.51
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc177Q3UHB8 706 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.5 ms