RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 ART3Q13508 389 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 DECR1Q16698 335 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 WLSQ5T9L3 541 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CPTPQ5TA50 214 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 OR4N2Q8NGD1 307 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SORT1Q99523 831 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EQTNQ9NQ60 294 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 CBLCQ9ULV8 474 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TTC36A6NLP5 189 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PRSS44E7EML9 344 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TSPAN2O60636 221 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PSMG1O95456 288 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 TRPC1P48995 793 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PRKAG1P54619 331 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EMX2Q04743 252 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 NATD1Q8N6N6 113 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 COQ3Q9NZJ6 369 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.45■□□□□ 0.87
SYT6-210ENST00000641643 ADAM10O14672 748 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 SNPHO15079 494 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PRPS1L1P21108 318 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 GAB1Q13480 694 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 SMU1Q2TAY7 513 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 EMC4Q5J8M3 183 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 NUP43Q8NFH3 380 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 C2orf72A6NCS6 295 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 G6PDP11413 515 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PTGDSP41222 190 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R2AP63151 447 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PRR5P85299 388 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 ATG16L1Q676U5 607 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 NUF2Q9BZD4 464 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 UBQLN3Q9H347 655 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 THAP1Q9NVV9 213 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 HAO1Q9UJM8 370 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 HRH3Q9Y5N1 445 aa20.44■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PRB8 838 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 EMC8O43402 210 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 KCNH1O95259 989 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 HPNP05981 417 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 LAMP1P11279 417 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PTPN6P29350 595 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 GABRA3P34903 492 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 RFX3P48380 749 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 MLC1Q15049 377 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.43■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 WDR1O75083 606 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 CBR3O75828 277 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 CLDN14O95500 239 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 ACVR2AP27037 513 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 GCKP35557 465 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 ACAD11Q709F0 780 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 GPR151Q8TDV0 419 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 SLC9A6Q92581 669 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 RND1Q92730 232 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 PNPOQ9NVS9 261 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 ASIC5Q9NY37 505 aa20.42■□□□□ 0.86
SYT6-210ENST00000641643 WIF1Q9Y5W5 379 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms