RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	GABRA3	P34903	492 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFX3	P48380	749 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSG6	Q00889	435 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PMPCA	Q10713	525 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE7A	Q13946	482 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MPP2	Q14168	576 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF385B	Q569K4	471 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NATD1	Q8N6N6	113 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGARP	Q8TDB4	240 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	EQTN	Q9NQ60	294 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBLC	Q9ULV8	474 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		15.16	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PRB8	838 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNPH	O15079	494 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBR3	O75828	277 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNH1	O95259	989 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HPN	P05981	417 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCT	P40126	519 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR5	P85299	388 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAB1	Q13480	694 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGR1	Q14914	329 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMC4	Q5J8M3	183 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF787	Q6DD87	383 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUP43	Q8NFH3	380 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR151	Q8TDV0	419 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASB5	Q8WWX0	329 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NIN	Q8N4C6	2090 aa		15.15	■□□□□ 0.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPN13	Q12923	2485 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMC8	O43402	210 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPN6	P29350	595 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMX2	Q04743	252 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	BST1	Q10588	318 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMU1	Q2TAY7	513 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC9A6	Q92581	669 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBQLN3	Q9H347	655 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		15.14	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFLAR	O15519	480 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMG1	O95456	288 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMP1	P11279	417 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	G6PD	P11413	515 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP4B1	P13584	511 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGER4	P35408	488 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGDS	P41222	190 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRIM2	P49643	509 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CASP8	Q14790	479 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLC1	Q15049	377 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CES4A	Q5XG92	561 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATG16L1	Q676U5	607 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERHL	Q9NQF3	203 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	AHRR	A9YTQ3	701 aa		15.12	■□□□□ 0.01

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