RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 ETFDHQ16134 617 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FRG2Q64ET8 278 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 KLHL29Q96CT2 875 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FRG2BQ96QU4 278 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 REG4Q9BYZ8 158 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PSME2Q9UL46 239 aa15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 A0A087X1B8 175 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 SEC14L5O43304 696 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 C8BP07358 591 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CT45A8P0DMV1 189 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CT45A9P0DMV2 189 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 KRT20P35900 424 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PNLIPRP2P54317 469 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OCRLQ01968 901 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PON3Q15166 354 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 RAET1LQ5VY80 246 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 METTL4Q8N3J2 472 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FADS6Q8N9I5 356 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CDK15Q96Q40 435 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 SNX24Q9Y343 169 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.18■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 C17orf51A8MQB3 221 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 LINC01387J3KSC0 135 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OR7A17O14581 309 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CD5LO43866 347 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FCGR2AP12318 317 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 HK1P19367 917 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 IL12BP29460 328 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 IDUAP35475 653 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CORO7P57737 925 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF675Q8TD23 568 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 VSTM2LQ96N03 204 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF681Q96N22 645 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 DSN1Q9H410 356 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa15.17■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 29.8
FCHO1-230ENST00000600058 OR2M5A3KFT3 312 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OVOL3O00110 214 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 F12P00748 615 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 GSTA2P09210 222 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CLDN20P56880 219 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 IRF9Q00978 393 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 IFT88Q13099 833 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 GANABQ14697 944 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ACAP2Q15057 778 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 PPM1NQ8N819 430 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OR2M3Q8NG83 312 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 ERP27Q96DN0 273 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.16■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CADP27708 2225 aa15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 H3BML4 177 aa15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 AQP8O94778 261 aa15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 EVI2BP34910 448 aa15.15■□□□□ 0.02
FCHO1-230ENST00000600058 CCNG1P51959 295 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms