RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	RAP1GDS1	P52306	607 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CTBP2	P56545	445 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	IRF8	Q02556	426 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	P2RY6	Q15077	328 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PDK4	Q16654	411 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TTC27	Q6P3X3	843 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD7	Q92527	254 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	RGMA	Q96B86	450 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	COL21A1	Q96P44	957 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ABCD4	O14678	606 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SCO2	O43819	266 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	STK16	O75716	305 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CPM	P14384	443 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PIK3R1	P27986	724 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	AGTR1	P30556	359 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TTK	P33981	857 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EMD	P50402	254 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	XK	P51811	444 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CORO7	P57737	925 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TAS2R39	P59534	338 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ACTG1	P63261	375 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	RAB35	Q15286	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	LTB4R	Q15722	352 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TBCC	Q15814	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SGCB	Q16585	318 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MED27	Q6P2C8	311 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GALNT7	Q86SF2	657 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	T	O15178	435 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ACOX3	O15254	700 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	KRT14	P02533	472 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PGAM1	P18669	254 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	IL2RG	P31785	369 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NR4A2	P43354	598 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR4D1	Q15615	310 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MIDN	Q504T8	468 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CERS2	Q96G23	380 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.73	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms