RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TPD52L3Q96J77 140 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 COL21A1Q96P44 957 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA4CQ9C0C4 833 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR45Q9Y484 360 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TIPRLO75663 272 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR143P51810 404 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRA2Q8N149 483 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PKP2Q99959 881 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1RAPQ9NPH3 570 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXJ2Q9P0K8 574 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM229AB2RXF0 380 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN1SWP03999 348 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A8P0DMV1 189 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A9P0DMV2 189 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SESN3P58005 492 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI44LQ53G44 452 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CT45A2Q5DJT8 189 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2-ASQ6U949 168 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FRRS1Q6ZNA5 592 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC29A4Q7RTT9 530 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NLGN4XQ8N0W4 816 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf47Q8NEP4 570 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 LRTOMTQ8WZ04 291 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT9Q9BW91 350 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPAQ9BY32 194 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 DTX4Q9Y2E6 619 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GFRA3O60609 400 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TCN2P20062 427 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 DRD5P21918 477 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ10P78508 379 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNEQ04844 493 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP27C1Q4G0S4 372 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 VTCN1Q7Z7D3 282 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3R3Q92569 461 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NACC2Q96BF6 587 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 G6PC3Q9BUM1 346 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT52Q9Y366 437 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 C21orf140B9A014 251 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK2O95069 426 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ALPPP05187 535 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 UMODP07911 640 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CD247P20963 164 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGAP37287 484 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ5P48544 419 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXL2P58012 376 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6AP1Q15904 470 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NPSR1Q6W5P4 371 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF619Q8N2I2 560 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM110BQ8TC76 370 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SPPL2AQ8TCT8 520 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 CT55Q8WUE5 264 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 VMP1Q96GC9 406 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 BDH2Q9BUT1 245 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR87Q9BY21 358 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 VCX3BQ9H321 246 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQ72 361 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FRG2CA6NGY1 282 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 STMND1H3BQB6 276 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TPST1O60507 370 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP3P05413 133 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS15P62841 145 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GABREP78334 506 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 EBPQ15125 230 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX5LQ8IYB4 626 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF321PQ8N8H1 164 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8K3Q8NH51 312 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PROX1Q92786 737 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PINK1Q9BXM7 581 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLCQ9ULV8 474 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10H1Q9Y4A9 318 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRP01130 860 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP11P24347 488 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNC4Q03721 635 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP7Q16829 419 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 OIT3Q8WWZ8 545 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ADIPOR1Q96A54 375 aa28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms