RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD8Q96LT4 415 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 FN3KQ9H479 309 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA1P01562 189 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 IL32P24001 234 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PROX2Q3B8N5 592 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ANKK1Q8NFD2 765 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TEPSINQ96N21 525 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PELI2Q9HAT8 420 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SYT14Q8NB59 555 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PTGESO14684 152 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GPR150Q8NGU9 434 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T35Q8NGX2 323 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A8O95907 504 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PER3P56645 1201 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 STK35Q8TDR2 534 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PEX11GQ96HA9 241 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CAMLGP49069 296 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GMLQ99445 158 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK13Q9HB14 408 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GPX3P22352 226 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PTH2RP49190 550 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CHST14Q8NCH0 376 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CHFRQ96EP1 664 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PITX2Q99697 317 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 NELFAQ9H3P2 528 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 LYRM1O43325 122 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 LRP8Q14114 963 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP77Q6ZQR2 320 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T4Q8NH00 348 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 MMP28Q9H239 520 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 HMX3A6NHT5 357 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 M0R3H8 397 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CDK4P11802 303 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SNAPC3Q92966 411 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ARL11Q969Q4 196 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SGCEO43556 437 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 JUNDP17535 347 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN6P29350 595 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 POU4F3Q15319 338 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF674Q2M3X9 581 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 FIBINQ8TAL6 211 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JMP0 313 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 AMY2AP04746 511 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 RAET1LQ5VY80 246 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CGB2Q6NT52 195 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 GPR174Q9BXC1 333 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 PCGF2P35227 344 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SOX9P48436 509 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CST6Q15828 149 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 AAK1Q2M2I8 961 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TRIB2Q92519 343 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ELMOD3Q96FG2 381 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 DPH1Q9BZG8 443 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM64BA6NI03 449 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SPDEFO95238 335 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 JMJD7P0C870 316 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH3B1P43353 468 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 WNT4P56705 351 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 FAM205BPQ63HN1 556 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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