RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	FBXL16	Q8N461	479 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	OR2L2	Q8NH16	312 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	GGH	Q92820	318 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ULK4	Q96C45	1275 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	S100A14	Q9HCY8	104 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MTRR	Q9UBK8	725 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		2.68	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TMEM129	A0AVI4	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ACOD1	A6NK06	481 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084		A8MXK9	166 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ANHX	E9PGG2	379 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	B4GAT1	O43505	415 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	AKAP3	O75969	853 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ZNF286B	P0CG31	522 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	GHR	P10912	638 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ODC1	P11926	461 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ANPEP	P15144	967 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	GJB2	P29033	226 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	FCGR2C	P31995	323 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CXCL12	P48061	93 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TNFSF10	P50591	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CRYBA2	P53672	197 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	NME5	P56597	212 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	KIAA1024L	P59773	190 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ERVK-16	P61578	105 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	LCP2	Q13094	533 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	RPS6KA1	Q15418	735 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084		Q6ZR54	194 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	NLRP14	Q86W24	1093 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	LAX1	Q8IWV1	398 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SPC24	Q8NBT2	197 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	C11orf52	Q96A22	123 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	PINK1	Q9BXM7	581 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	RAI14	Q9P0K7	980 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	KCNK6	Q9Y257	313 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CLUH	O75153	1309 aa		2.67	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ZFHX3	Q15911	3703 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	NID2	Q14112	1375 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	INPP4B	O15327	924 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SYT7	O43581	403 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	GAS8	O95995	478 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CCDC192	P0DO97	292 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SKIL	P12757	684 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CPA3	P15088	417 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ATP6V1B1	P15313	513 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ADORA1	P30542	326 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	OR1D2	P34982	312 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CCR4	P51679	360 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MEF2D	Q14814	521 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SPHAR	Q15513	63 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	C3AR1	Q16581	482 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SGCB	Q16585	318 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	CARM1	Q86X55	608 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		2.66	□□□□□ -1.98
COX11-208	ENST00000576084	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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