RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 NAA40Q86UY6 237 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FGGYQ96C11 551 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SGTBQ96EQ0 304 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 LRCH3Q96II8 777 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CERS4Q9HA82 394 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CHRNB4P30926 498 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CLCNKAP51800 687 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 STC1P52823 247 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 PDGFRLQ15198 375 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 RNF151Q2KHN1 245 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FAM182BQ5T319 152 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 GPR148Q8TDV2 347 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 MUL1Q969V5 352 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SMOXQ9NWM0 555 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ARVCFO00192 962 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TLL1O43897 1013 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SDC3O75056 442 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CSTAP01040 98 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 IL1AP01583 271 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CCNOP22674 350 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 PHYHD1Q5SRE7 291 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FAM124AQ86V42 546 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ST7LQ8TDW4 575 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 PINK1Q9BXM7 581 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 IL21RQ9HBE5 538 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CPED1A4D0V7 1026 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 NEMP2A6NFY4 417 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TRAPPC6AO75865 159 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 APBB3O95704 486 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TK1P04183 234 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 H3F3AP84243 136 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR10K2Q6IF99 312 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FUT10Q6P4F1 479 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 LANCL3Q6ZV70 420 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SLC15A4Q8N697 577 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR5D16Q8NGK9 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CASD1Q96PB1 797 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 LHPPQ9H008 270 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 A6NHS1 94 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 MEIS2O14770 477 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 INHAP05111 366 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ACVR1BP36896 505 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 BDKRB1P46663 353 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 NPBWR1P48145 328 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 STK19P49842 368 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ZNF33BQ06732 778 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 GKN2Q86XP6 184 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SGK3Q96BR1 496 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.85□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 C1orf226A1L170 272 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 DPM1O60762 260 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 MED6O75586 246 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ADH1BP00325 375 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 MAS1P04201 325 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 MMP3P08254 477 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 ELK1P19419 428 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 SHMT2P34897 504 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 FOXK1P85037 733 aa4.84□□□□□ -1.63
SMG1-211ENST00000565324 TPGS2Q68CL5 300 aa4.84□□□□□ -1.63
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