RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 ANKRA2Q9H9E1 313 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 MAT2BQ9NZL9 334 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ZNF639Q9UID6 485 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 OR6C70A6NIJ9 312 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TO15178 435 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ACOX3O15254 700 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TSPAN2O60636 221 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 REM1O75628 298 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 CPMP14384 443 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ADH6P28332 368 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GZMKP49863 264 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 EMDP50402 254 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 CTBP2P56545 445 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 CR1LQ2VPA4 569 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 SPANXN3Q5MJ09 141 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 BEND4Q6ZU67 534 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GABRG1Q8N1C3 465 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 OR4K17Q8NGC6 315 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 OR52R1Q8NGF1 315 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 TMCO6Q96DC7 493 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 SLC35A4Q96G79 324 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 BRINP2Q9C0B6 783 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 FLRT3Q9NZU0 649 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 MED11Q9P086 117 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 PLCE1Q9P212 2302 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-230ENST00000551968 UQCRHLA0A096LP55 91 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SCO2O43819 266 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PLGP00747 810 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CTAGE8P0CG41 777 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 DRD5P21918 477 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PPICP45877 212 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CDH11P55287 796 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CORO7P57737 925 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GGTLC2Q14390 218 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 LTB4RQ15722 352 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SGCBQ16585 318 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FAM180BQ6P0A1 224 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CYP20A1Q6UW02 462 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TMEM139Q8IV31 216 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TCAIMQ8N3R3 496 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 STEAP2Q8NFT2 490 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 OR4K14Q8NGD5 310 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NXNL1Q96CM4 212 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ZBTB26Q9HCK0 441 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NPAP1Q9NZP6 1156 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 VWC2LB2RUY7 222 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 E7EQL1 145 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 OPN1LWP04000 364 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 COL6A2P12110 1019 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FCGR2AP12318 317 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PORP16435 677 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 AGTR1P30556 359 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 DEFA6Q01524 100 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 MAP4K2Q12851 820 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 STX5Q13190 355 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SFRP5Q5T4F7 317 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SULT1C3Q6IMI6 304 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NPSR1Q6W5P4 371 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PDPRQ8NCN5 879 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 OR4N2Q8NGD1 307 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PROX1Q92786 737 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EXT2Q93063 718 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 UBE2E3Q969T4 207 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 C3orf49Q96BT1 292 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NPAS1Q99742 590 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PRRG4Q9BZD6 226 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CD244Q9BZW8 370 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 WDR41Q9HAD4 459 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 XPR1Q9UBH6 696 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 RYR3Q15413 4870 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CT45A8P0DMV1 189 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms