RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCN1P31025 176 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIGAP37287 484 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXO1Q12778 655 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM198Q66K66 360 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC73Q6P1J9 531 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRR22Q8IZ63 422 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF138Q8WVD3 245 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NTNG2Q96CW9 530 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TEX37Q96LM6 180 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EBF4Q9BQW3 602 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DOHHQ9BU89 302 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HHATLQ9HCP6 504 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EQTNQ9NQ60 294 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A0G2JMM0 328 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1W2PPB8 328 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1W2PRS3 328 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HS6ST1O60243 411 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UGT2B11O75310 529 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 REM1O75628 298 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL33O95760 270 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ALOX5P09917 674 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MST1P26927 711 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASP3P42574 277 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLGLB1Q02325 96 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBPJQ06330 500 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TP53BP2Q13625 1128 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PACS2Q86VP3 889 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GHDCQ8N2G8 530 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RILPQ96NA2 401 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RABEP2Q9H5N1 569 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPHS2Q9NP85 383 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPATCH2Q9NW75 528 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.06■□□□□ 0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM234BA2RU67 622 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PINLYPA6NC86 204 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UQCRC2P22695 453 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL12AP29459 219 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GABRA3P34903 492 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOAT1P35610 550 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGEA8P43361 318 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNASE1L1P49184 302 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRKAG1P54619 331 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NME5P56597 212 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHC1P78364 1004 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNC4Q03721 635 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GAB1Q13480 694 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RCAN2Q14206 197 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SQLEQ14534 574 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GFRALQ6UXV0 394 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COX18Q8N8Q8 333 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPR151Q8TDV0 419 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MARK4Q96L34 752 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR52E6Q96RD3 313 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADOQ96SZ5 270 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BTBD2Q9BX70 525 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIGUQ9H490 435 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RMND5AQ9H871 391 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROK2Q9HC23 129 aa15.05■□□□□ -0
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms