RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	NPAS1	Q99742	590 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557		H3BML4	177 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557		K7EPI3	171 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN8	O00124	270 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TP73	O15350	636 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ABCB7	O75027	752 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MTHFD2	P13995	350 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	HK1	P19367	917 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ARFIP1	P53367	373 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CASP9	P55211	416 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CUL3	Q13618	768 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TAB1	Q15750	504 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ISCA2	Q86U28	154 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	HBEGF	Q99075	208 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ALG9	Q9H6U8	611 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TG	P01266	2768 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PP18	115 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557		H0YIV9	168 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OPN1LW	P04000	364 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ATP1B1	P05026	303 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	KLK1	P06870	262 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT13	Q86X67	352 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	OPTC	Q9UBM4	332 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SCO2	O43819	266 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FADS1	O60427	444 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LMX1B	O60663	402 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CD3E	P07766	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SRD5A1	P18405	259 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CFP	P27918	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C21orf58	P58505	322 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V0D1	P61421	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	POU4F1	Q01851	419 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FGFBP1	Q14512	234 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-222	ENST00000533557	EGR1	P18146	543 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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