RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 WDR45Q9Y484 360 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SCN2AQ99250 2005 aa14.91□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 C17orf105B2RV13 164 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 H0YAE9 185 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 FFAR1O14842 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 E2F6O75461 281 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 STX11O75558 287 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DIRAS1O95057 198 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 RRM2P31350 389 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SLC37A1P57057 533 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 E2F1Q01094 437 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 EPS8Q12929 822 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SLC36A3Q495N2 470 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 USP51Q70EK9 711 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PRSS33Q8NF86 280 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 GATA6Q92908 595 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 ART5Q96L15 291 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 CDC6Q99741 560 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PRRX2Q99811 253 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 LAMA1P25391 3075 aa14.9□□□□□ -0.02
SNHG6-201ENST00000520348 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 E9PQ18 207 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 KCNK2O95069 426 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 IFNA16P05015 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CT45A8P0DMV1 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CT45A9P0DMV2 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 THRBP10828 461 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 TGM1P22735 817 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 GABRA3P34903 492 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 MERTKQ12866 999 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 NPTX1Q15818 432 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 RFX4Q33E94 735 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 RNF220Q5VTB9 566 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 LACC1Q8IV20 430 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 GPR151Q8TDV0 419 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF721Q8TF20 911 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 PIK3R3Q92569 461 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 NR4A3Q92570 626 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZG16BQ96DA0 208 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 FUZQ9BT04 418 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ACER3Q9NUN7 267 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CFL2Q9Y281 166 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 TNFRSF11BO00300 401 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 RFPL3O75679 317 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CCL4P13236 92 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CAPGP40121 348 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 ARHGDIAP52565 204 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 PDK3Q15120 406 aa14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
SNHG6-201ENST00000520348 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms