RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ERF	P50548	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	DIO3	P55073	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF4	P78317	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A0A6YYD5	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846		B9A039	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	G6PD	P11413	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	S100A3	P33764	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	STT3A	P46977	705 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CASP6	P55212	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	HSF1	Q00613	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OPN5	Q6U736	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A1W2PRB8	838 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM107A	O95990	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SDC1	P18827	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	GABRA3	P34903	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	RAD52	P43351	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	MEOX1	P50221	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	HK2	P52789	917 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	DGKQ	P52824	942 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CORO7	P57737	925 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXW4	P57775	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	MXRA7	P84157	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SRY	Q05066	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLVS1-205	ENST00000519846	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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