RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 CHST1O43916 411 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 HCN1O60741 890 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRAF2O60831 178 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SRP72O76094 671 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 NTSP30990 170 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARL3P36405 182 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPP38P78345 283 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPP2R5CQ13362 524 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRB7Q14451 532 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 AANATQ16613 207 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 LGSNQ5TDP6 509 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 MEDAGQ5VYS4 303 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 KLHL10Q6JEL2 608 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CHST3Q7LGC8 479 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GATSQ8NAP1 163 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SMYD1Q8NB12 490 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 FNDC8Q8TC99 324 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 USP6NLQ92738 828 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 MCHR2Q969V1 340 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAB7BQ96AH8 199 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ABCG8Q9H221 673 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CXXC4Q9H2H0 198 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GDE1Q9NZC3 331 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 H0YIG0 161 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 OAS1P00973 400 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 IL4P05112 153 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PYGLP06737 847 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GHRP10912 638 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GJB2P29033 226 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TM4SF1P30408 202 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PCGF2P35227 344 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 OPRD1P41143 372 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 KIR2DS2P43631 304 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 NMUP48645 174 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 STAT2P52630 851 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 METAP1P53582 386 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 VCPP55072 806 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CNTN2Q02246 1040 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF85Q03923 595 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF616Q08AN1 781 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 FOXF1Q12946 379 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF154Q13106 437 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PTPRCAPQ14761 206 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 P2RY14Q15391 338 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAB41Q5JT25 222 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 Q6ZRG5 221 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 LUZP1Q86V48 1076 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 WDR49Q8IV35 697 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TDHQ8IZJ6 230 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TTC30BQ8N4P2 665 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSNK1A1LQ8N752 337 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSPAN14Q8NG11 270 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR52I1Q8NGK6 324 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TEKT4Q8WW24 435 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SEPT8Q92599 483 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSSK2Q96PF2 358 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TAAR1Q96RJ0 339 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SULT4A1Q9BR01 284 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC25A19Q9HC21 320 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 EPS15L1Q9UBC2 864 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 YJEFN3A6XGL0 299 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF850A8MQ14 1090 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 LGALS9O00182 355 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ACSL4O60488 711 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TNFSF13O75888 250 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDE5AO76074 875 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGLL1P15814 213 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSMC3P17980 439 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAPK4P31152 587 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 PITPNAQ00169 270 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBXN1Q04323 297 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 FMODQ06828 376 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAMLD1Q13495 774 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARFRP1Q13795 201 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 IL11RAQ14626 422 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM46CQ5VWP2 391 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-904P-201ENST00000516206 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms