RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515942.1

RN7SKP46-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP46, Length 234 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP46-201ENST00000515942 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GPSM3Q9Y4H4 160 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ETV7Q9Y603 341 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MYLKQ15746 1914 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 C2orf78A6NCI8 922 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TRABD2BA6NFA1 517 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 LRRC72A6NJI9 287 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 HSPB2A8KAH6 182 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 IQCF5A8MTL0 148 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 A8MXK9 166 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 WRBO00258 174 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 SULT1C2O00338 296 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TREHO43280 583 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 AKR7A2O43488 359 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 RBBP9O75884 186 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 KRT33AO76009 404 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 UBXN7O94888 489 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 OR2F2O95006 317 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 OR5F1O95221 314 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PRAMEF12O95522 483 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 C6orf47O95873 294 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 IGHA1P01876 353 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 F11P03951 625 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 BCHEP06276 602 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ACSM4P0C7M7 580 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GKN3PP0CG01 181 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FAM157BP0CG42 384 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CALCBP10092 127 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ALPPL2P10696 532 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 AKR1A1P14550 325 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MGMTP16455 207 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 NDUFV2P19404 249 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FPR3P25089 353 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TACR1P25103 407 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MPIP34949 423 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ETV5P41161 510 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 OR1E2P47887 323 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GPR143P51810 404 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 EPHA5P54756 1037 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PFN3P60673 137 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 RAB5BP61020 215 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 HBA1P69905 142 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FABP5Q01469 135 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 BTN1A1Q13410 526 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 NAE1Q13564 534 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 OR2F1Q13607 317 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PTPRCAPQ14761 206 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 POU4F3Q15319 338 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CHRNA6Q15825 494 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FAM189A2Q15884 450 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 HSPB2Q16082 182 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 DECR1Q16698 335 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TCTE1Q5JU00 501 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TMEM65Q6PI78 240 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 C11orf88Q6PI97 169 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GAREM2Q75VX8 874 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 GPR142Q7Z601 462 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 IFNL1Q8IU54 200 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CDH26Q8IXH8 852 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 PXT1Q8NFP0 134 aa4.55□□□□□ -1.68
RN7SKP46-201ENST00000515942 OR7D4Q8NG98 312 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms