RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MNS1Q8NEH6 495 aa15.34■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 EBPLQ9BY08 206 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SENP1Q9P0U3 644 aa15.34■□□□□ 0.05
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HERC3-211ENST00000513325 B4DXG7 233 aa15.33■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 RNF138Q8WVD3 245 aa15.33■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.33■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 NFU1Q9UMS0 254 aa15.33■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.33■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 OR10H1Q9Y4A9 318 aa15.33■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 HRGP04196 525 aa15.32■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 PSPHP78330 225 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 PSG6Q00889 435 aa15.32■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 LCA5Q86VQ0 697 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DACH2Q96NX9 599 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 PIGMQ9H3S5 423 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPR1 153 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 SH3D21A4FU49 640 aa15.31■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 TNFSF13O75888 250 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 GOSR1O95249 250 aa15.31■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.31■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 SERTM1A2A2V5 107 aa15.3■□□□□ 0.04
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HERC3-211ENST00000513325 CPOXP36551 454 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 MC3RP41968 323 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 GSTM5P46439 218 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DIO3P55073 304 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 BCL2A1Q16548 175 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HERC3-211ENST00000513325 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.3■□□□□ 0.04
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