RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SCO2O43819 266 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SYNGR4O95473 234 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CD8AP01732 235 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 THBS1P07996 1170 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 S1PR1P21453 382 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DRD5P21918 477 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ADH6P28332 368 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 PIK3CBP42338 1070 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ARFIP1P53367 373 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 C21orf58P58505 322 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ZNF844Q08AG5 666 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GUSBP1Q15486 140 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TSC22D1Q15714 1073 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TAB1Q15750 504 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CCDC25Q86WR0 208 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 NUDT13Q86X67 352 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ZNF525Q8N782 197 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 C3orf56Q8N813 242 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ELOA3Q8NG57 546 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DERL2Q9GZP9 239 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 MED11Q9P086 117 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 WHRNQ9P202 907 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 XPR1Q9UBH6 696 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 OPTCQ9UBM4 332 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 PLLPQ9Y342 182 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.51□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 A0A096LNT2 108 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 OR2M5A3KFT3 312 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SLC35F4A4IF30 521 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 NDUFB5O43674 189 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 RAMP1O60894 148 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CCDC166P0CW27 439 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CREB1P16220 341 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 EPORP19235 508 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 IL11P20809 199 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CXCR5P32302 372 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 BSGP35613 385 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SLC6A8P48029 635 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CDH11P55287 796 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 IRF9Q00978 393 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 MAP4K2Q12851 820 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 STX5Q13190 355 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GGTLC2Q14390 218 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DTX2Q86UW9 622 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CEP112Q8N8E3 955 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 PROX1Q92786 737 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 C3orf49Q96BT1 292 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 C1orf159Q96HA4 380 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TRIM2Q9C040 744 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GLRX2Q9NS18 164 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CADP27708 2225 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 DPRXA6NFQ7 191 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TO15178 435 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TGFAP01135 160 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TUBBP07437 444 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ITGA2P17301 1181 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 EGR1P18146 543 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 LGSNQ5TDP6 509 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 TTC27Q6P3X3 843 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-208ENST00000512153 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms