RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CD83Q01151 205 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 TGM3Q08188 693 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 QPRTQ15274 297 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SIMC1Q8NDZ2 872 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 DIO2Q92813 273 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 SOSTQ9BQB4 213 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 PRRG3Q9BZD7 231 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 NDEL1Q9GZM8 345 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 EQTNQ9NQ60 294 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 LIPT1Q9Y234 373 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-221ENST00000511747 CELP19835 753 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ST3GAL3Q11203 375 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 P2RY14Q15391 338 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RTL10Q7L3V2 364 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf18Q8NEA5 215 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OR56A1Q8NGH5 318 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 POF1BQ8WVV4 589 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RFKQ969G6 155 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7D2Q96RA2 312 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PRDM7Q9NQW5 492 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MALT1Q9UDY8 824 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 CHST2Q9Y4C5 530 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1A2Q9Y585 309 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 SYT5O00445 386 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 LATO43561 262 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 YES1P07947 543 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 GNSP15586 552 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM23P36406 574 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 C18orf63Q68DL7 685 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PLET1Q6UQ28 207 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ACSL5Q9ULC5 683 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB28P51157 221 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PRR5P85299 388 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ZIC1Q15915 447 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 AADACL4Q5VUY2 407 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HDAC8Q9BY41 377 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 NCR1O76036 304 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-DPB1P04440 258 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ACP5P13686 325 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 CPN2P22792 545 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 AVPR1BP47901 424 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 DSG2Q14126 1118 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 INSL4Q14641 139 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIQKQ629K1 86 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF438Q7Z4V0 828 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 GJD3Q8N144 294 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4Q3Q8NH05 313 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGXQ8TBF5 258 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGDIGQ99819 225 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ATF6BQ99941 703 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ENTPD4Q9Y227 616 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 SHISA3A0PJX4 238 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 SURF4O15260 269 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HCN1O60741 890 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 GUCY1B2O75343 617 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 AIFM1O95831 613 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-DQB1P01920 261 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 EVX1P49640 407 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 GAB4Q2WGN9 574 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 CACUL1Q86Y37 369 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 NKAIN4Q8IVV8 208 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 NEIL3Q8TAT5 605 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 OSTF1Q92882 214 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB7BQ96AH8 199 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PSKH1P11801 424 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 HLA-DMAP28067 261 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MC3RP41968 323 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 PAMR1Q6UXH9 720 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 SUSD6Q92537 303 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 NR4A3Q92570 626 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MOAP1Q96BY2 351 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF649Q9BS31 505 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 IL20Q9NYY1 176 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 IL20RAQ9UHF4 553 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 CES1P1Q9UKY3 287 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPM6Q9BX84 2022 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms