RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 NXNL1Q96CM4 212 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 KLHL29Q96CT2 875 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC35A4Q96G79 324 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 DSN1Q9H410 356 aa14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ACOT9Q9Y305 439 aa14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 ABCA1O95477 2261 aa14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 H3BML4 177 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 FCGR2AP12318 317 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 MTHFD2P13995 350 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 CLDN15P56746 228 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TSPAN2O60636 221 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PCSK2P16519 638 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ALDH9A1P49189 494 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PNLIPRP2P54317 469 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PSPHP78330 225 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 IFT88Q13099 833 aa14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SGO1Q5FBB7 561 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 FRG2Q64ET8 278 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CYS1Q717R9 158 aa14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 MED11Q9P086 117 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 STOML1Q9UBI4 398 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SNX24Q9Y343 169 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 SCO2O43819 266 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CT45A8P0DMV1 189 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CT45A9P0DMV2 189 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CCNG1P51959 295 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CLDN20P56880 219 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CORO7P57737 925 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 BEND4Q6ZU67 534 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 STK32CQ86UX6 486 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 PPM1NQ8N819 430 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 BTBD9Q96Q07 612 aa14.24□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.24□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.24□□□□□ -0.13
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SH3BP2-215ENST00000510074 HAX1O00165 279 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TP73O15350 636 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 CLOCKO15516 846 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 AQP8O94778 261 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ESRRBO95718 433 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ACVR1BP36896 505 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GAS1P54826 345 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 STX5Q13190 355 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 ACAP2Q15057 778 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 KLC3Q6P597 504 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
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