RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.07□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM53BQ14153 422 aa10.06□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 UGT2B17O75795 530 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP7B1O75881 506 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 NKX2-2O95096 273 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 NSA2O95478 260 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 CBX7O95931 251 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 THBS1P07996 1170 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 ALOX5P09917 674 aa10.05□□□□□ -0.8
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