RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TBCC	Q15814	346 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIK1L	Q8N165	341 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10A5	Q9H207	317 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR160	Q9UJ42	338 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DKKL1	Q9UK85	242 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A20	A6NK97	555 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ICOSLG	O75144	302 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1B	O75688	479 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM6	O95932	706 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CLPS	P04118	112 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		9.78	□□□□□ -0.84
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SKAP2-209	ENST00000497511	GALNS	P34059	522 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GGT5	P36269	586 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ELK3	P41970	407 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP2	P42575	452 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT5	Q09328	741 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	BEX5	Q5H9J7	111 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA1	Q6PCB0	445 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF175	Q8N4F7	328 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7G3	Q8NG95	312 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD4	Q96DR4	205 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A14	Q96JA4	679 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	9.78	□□□□□ -0.84
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SKAP2-209	ENST00000497511	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DERL2	Q9GZP9	239 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	EHD3	Q9NZN3	535 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WHRN	Q9P202	907 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CFL2	Q9Y281	166 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PSAT1	Q9Y617	370 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZAN	Q9Y493	2812 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPP1	O14494	284 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	AIFM1	O95831	613 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC166	P0CW27	439 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NAGA	P17050	411 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0D1	P61421	351 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LAS2	Q8IYD9	372 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OMA1	Q96E52	524 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NODAL	Q96S42	347 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CD244	Q9BZW8	370 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OPTC	Q9UBM4	332 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PROCR	Q9UNN8	238 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK7	Q96N67	2140 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X1B8	175 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PR48	441 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85

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