RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PGK2	P07205	417 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZP3	P21754	424 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NF2	P35240	595 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RFC2	P35250	354 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	EMD	P50402	254 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IL18R1	Q13478	541 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	AGK	Q53H12	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM110	Q86TL2	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	AMZ2	Q86W34	360 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CCNY	Q8ND76	341 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	URGCP	Q8TCY9	931 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC51	Q96ER9	411 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP6V0B	Q99437	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DPH7	Q9BTV6	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	PGK1	P00558	417 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC192	P0DO97	292 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RALA	P11233	206 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	MGMT	P16455	207 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	UGT1A3	P35503	534 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	TRPC1	P48995	793 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF699	Q32M78	642 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	PARG	Q86W56	976 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0U1RRA0	63 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	SSX5	O60225	188 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RAMP1	O60894	148 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	NOL4	O94818	638 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	TOX	O94900	526 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CXCL10	P02778	98 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	PRG2	P13727	222 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	IL2RG	P31785	369 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	STX17	P56962	302 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	SNX1	Q13596	522 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	LEG1	Q6P5S2	330 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR65	Q8IYL9	337 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	NEK11	Q8NG66	645 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	THAP9	Q9H5L6	903 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	EHF	Q9NZC4	300 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	USP6	P35125	1406 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615		H3BMH7	237 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615		H3BTX0	84 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC166	P0CW27	439 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	AHCY	P23526	432 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	POU3F4	P49335	361 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	WNT4	P56705	351 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	ZP4	Q12836	540 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP51A1	Q16850	503 aa		3.31	□□□□□ -1.88
CBWD5-231	ENST00000495615	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms