RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC6A11	P48066	632 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CLDN12	P56749	244 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DGCR2	P98153	550 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	HES5	Q5TA89	166 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR8K3	Q8NH51	312 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TDP1	Q9NUW8	608 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP20	O60882	483 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LALBA	P00709	142 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP2K6	P52564	334 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DSC1	Q08554	894 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SNX33	Q8WV41	574 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ORAI1	Q96D31	301 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OTUB2	Q96DC9	234 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MARK1	Q9P0L2	795 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SBF1	O95248	1867 aa		9.26	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHA2	P01877	340 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CPE	P16870	476 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ENPP1	P22413	925 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GRPR	P30550	384 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC6A12	P48065	614 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ST8SIA6	P61647	398 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TGM3	Q08188	693 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MLIP	Q5VWP3	458 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	PLPP6	Q8IY26	295 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2E3	Q969T4	207 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SGTB	Q96EQ0	304 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MCHR1	Q99705	422 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NRTN	Q99748	197 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ATF6B	Q99941	703 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ALG8	Q9BVK2	526 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RCE1	Q9Y256	329 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf226	A1L170	272 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRN3	E7EW58	273 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BNC9	293 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	FZD7	O75084	574 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CD160	O95971	181 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CSN2	P05814	226 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ACADM	P11310	421 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	TAP2	Q03519	686 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	RAB40B	Q12829	278 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CAMK1	Q14012	370 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	OPCML	Q14982	345 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GRHL3	Q8TE85	626 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SFXN2	Q96NB2	322 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	WDFY2	Q96P53	400 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	GSX2	Q9BZM3	304 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		9.25	□□□□□ -0.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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