RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKDD1BA6NHY2 528 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM166BA8MTA8 275 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf105B2RV13 164 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BCKDKO14874 412 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HCN1O60741 890 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LDB3O75112 727 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 STK16O75716 305 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HKR1P10072 659 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CCL3P10147 92 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CD1DP15813 335 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SAT1P21673 171 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CERS1P27544 350 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEA5P43359 124 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 COL10A1Q03692 680 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BIKQ13323 160 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BMPR2Q13873 1038 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SERTAD2Q14140 314 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RCN2Q14257 317 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC10A1Q14973 349 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4D1Q15615 310 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CES4AQ5XG92 561 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OPN5Q6U736 354 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RTL4Q6ZR62 310 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GPSM1Q86YR5 675 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LAS2Q8IYD9 372 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC15A4Q8N697 577 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PDPRQ8NCN5 879 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BBOF1Q8ND07 529 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NUBPLQ8TB37 319 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB10Q8WXI3 467 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 JADE3Q92613 823 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB24Q969Q5 203 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ESAMQ96AP7 390 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS39Q96JC1 886 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SMC6Q96SB8 1091 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 EGFL8Q99944 293 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MS4A8Q9BY19 250 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CDHR4A6H8M9 788 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 G3V3Y1 287 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT5O00445 386 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CLGNO14967 610 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 FGF17O60258 216 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR1O75083 606 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAG2O75638 210 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PIAS1O75925 651 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GPANK1O95872 356 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 IFNA16P05015 189 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC166P0CW27 439 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 GCSHP23434 173 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 PIGAP37287 484 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 STT3AP46977 705 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 HSPA7P48741 367 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 DNASE1L1P49184 302 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ART1P52961 327 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ARFIP1P53367 373 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 IST1P53990 364 aa5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6V0D1P61421 351 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms