RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488741.5

CREM-238, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2 BASIC

Gene CREM, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-238	ENST00000488741	FGF11	Q92914	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RFK	Q969G6	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FN3K	Q9H479	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741		F8W810	466 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	AGRP	O00253	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GPR171	O14626	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CTDSPL	O15194	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GPR39	O43194	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TBX19	O60806	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ATG13	O75143	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SOX14	O95416	240 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	TBX18	O95935	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CD160	O95971	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	POMC	P01189	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FURIN	P09958	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ELK1	P19419	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CD22	P20273	847 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RAB3A	P20336	220 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	NPR2	P20594	1047 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CCR7	P32248	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	BTC	P35070	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SOAT1	P35610	550 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SLC1A3	P43003	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CAPZA2	P47755	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	MTNR1A	P48039	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	KCNJ5	P48544	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	PITPNB	P48739	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	EPHA5	P54756	1037 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	LIM2	P55344	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	B2M	P61769	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	S100A12	P80511	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZXDB	P98169	803 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CDH18	Q13634	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	DOC2A	Q14183	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ZNF273	Q14593	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	GINS1	Q14691	196 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	OPCML	Q14982	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	CDKN3	Q16667	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-238	ENST00000488741	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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