RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 BNIP2Q12982 314 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 VEZF1Q14119 521 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 C4orf17Q53FE4 359 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RABL3Q5HYI8 236 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 DCAF10Q5QP82 559 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GCNT6Q5T4J0 391 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CALHM3Q86XJ0 350 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TAGAPQ8N103 731 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A8Q8N695 610 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 G6PC3Q9BUM1 346 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 BTBD2Q9BX70 525 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OR51I1Q9H343 314 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ALG2Q9H553 416 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 HHATLQ9HCP6 504 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CMTM6Q9NX76 183 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TEKT2Q9UIF3 430 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CREBBPQ92793 2442 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CDC14CA4D256 554 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CFAP73A6NFT4 308 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HRKO00198 91 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HMGN4O00479 90 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NME4O00746 187 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ABCB7O75027 752 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GMNNO75496 209 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 STAMBPO95630 424 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ARAFP10398 606 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ME2P23368 584 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PGM1P36871 562 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GZMMP51124 257 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FOXL2P58012 376 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PSG6Q00889 435 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 LIPEQ05469 1076 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CDC20Q12834 499 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DUSP8Q13202 625 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ATP1A4Q13733 1029 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CYP51A1Q16850 503 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PIGGQ5H8A4 983 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 COX18Q8N8Q8 333 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR2T12Q8NG77 320 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR10A6Q8NH74 314 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FBXO27Q8NI29 283 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC9A6Q92581 669 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF583Q96ND8 569 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR7D2Q96RA2 312 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 LHPPQ9H008 270 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 EQTNQ9NQ60 294 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CD300AQ9UGN4 299 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 A0A0G2JPF8 293 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 C5orf58C9J3I9 102 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TFPTP0C1Z6 253 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CT45A8P0DMV1 189 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CT45A9P0DMV2 189 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR12D1P0DN82 309 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ACP2P11117 423 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ETFAP13804 333 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GABRA3P34903 492 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PTGER1P34995 402 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PCGF2P35227 344 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KRT20P35900 424 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PIGAP37287 484 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GSK3BP49841 420 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CRISP3P54108 245 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HPCAP84074 193 aa10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms