RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476783.5

PTBP2-208, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene PTBP2, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NDUFS7	O75251	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NDUFS3	O75489	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TNFSF13	O75888	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SNX4	O95219	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SOD3	P08294	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM228B	P0C875	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC25A16	P16260	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SERPINF1	P36955	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NUDT6	P53370	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	RAB8A	P61006	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	MXRA7	P84157	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ASPH	Q12797	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A096LNT2	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783		H3BMM5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TP53I11	O14683	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PFDN6	O15212	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	HAUS5	O94927	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SERPING1	P05155	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	DANCR	P0C864	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	DPP4	P27487	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	HNF4A	P41235	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC1A1	P43005	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC6A12	P48065	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NAGLU	P54802	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	UCP3	P55916	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ARL4C	P56559	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CCZ1B	P86790	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	STX4	Q12846	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	DCST1	Q5T197	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	FAR2	Q96K12	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTBP2-208	ENST00000476783	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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